Экспертный совет утвержден Наблюдательным советом Фонда. В состав Экспертного совета входят академики и члены-корреспонденты РАН, ведущие ученые РФ, представители бизнеса и институтов развития. Председатель Экспертного совета Фонда - Алдошин Сергей Михайлович, научный руководитель Института проблем химической физики РАН.
В соответствии с утвержденным регламентом работы члены Экспертного совета:
разрабатывают порядки проведения конкурсов по отбору проектов
рассматривают и согласуют в соответствии с направлениями работы секций технические требования по конкурсам на выполнение НИОКР
разрабатывают перечень перспективных фокусных тематик программ Фонда в соответствии с последними тенденциями научных исследований и разработок
определяют порядок и сроки проведения объявленных сборов заинтересованностей с целью определения наиболее перспективных тематик научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ, а также направления для сбора предложений по формированию перспективных тематик НИОКР;
готовят предложения по совершенствованию процедуры отбора проектов по программам Фонда
принимают участие в экспертных жюри по программам Фонда